Marta Szachniuk
Marta Xymena Szachniuk (ur. 9 lutego 1974 w Poznaniu[1]) – polska inżynier informatyk i bioinformatyk, profesor nauk inżynieryjno-technicznych. Specjalizuje się w algorytmice, kombinatorycznych problemach biologii molekularnej, modelowaniu matematycznym oraz strukturach RNA[1]. Jest profesorem i kierownikiem Zakładu Bioinformatyki Strukturalnej w poznańskim Instytucie Chemii Bioorganicznej PAN[2] oraz profesorem w Instytucie Informatyki Wydziału Informatyki i Telekomunikacji Politechniki Poznańskiej[3][4]. Kieruje Laboratorium Bioinformatyki RNA w Europejskim Centrum Bioinformatyki i Genomiki[1].
| Data i miejsce urodzenia |
9 lutego 1974 |
|---|---|
| Profesor nauk inżynieryjno-technicznych | |
| Specjalność: bioinformatyka, algorytmika | |
| Alma Mater | |
| Doktorat |
2005 – informatyka |
| Habilitacja |
2015 – informatyka |
| Profesura |
2020 |
| Pracownik naukowy | |
| Uczelnia |
Politechnika Poznańska |
| Okres zatrudn. |
1999 - nadal |
| Instytut | |
| Okres zatrudn. |
2003 - nadal |
| Odznaczenia | |
| |
Życiorys
edytujW roku 1993 ukończyła I Liceum Ogólnokształcące im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu[1]. Studiowała na Politechnice Poznańskiej, gdzie w 1998 ukończyła studia magisterskie z informatyki na Wydziale Elektrycznym, a w 1999 - z matematyki na Wydziale Budowy Maszyn i Zarządzania. Stopień doktora nauk technicznych uzyskała na Wydziale Informatyki i Zarządzania PP w 2005 na podstawie rozprawy pt. Kombinatoryczna analiza widm 2D-NOESY w spektroskopii magnetycznego rezonansu jądrowego cząsteczek RNA, przygotowanej pod kierunkiem prof. Jacka Błażewicza. Habilitowała się w 2015 r. na podstawie pracy pt. Informatyczne aspekty opartej na NMR analizy struktur RNA. Tytuł profesora nauk inżynieryjno-technicznych został jej nadany w 2020[3]. Poza Politechniką od 2003 pracuje także w Instytucie Chemii Bioorganicznej PAN, gdzie w 2016 awansowała na stanowisko profesora nadzwyczajnego[1]. W latach 2011–2022 była wiceprezesem Polskiego Towarzystwa Bioinformatycznego[1]. W okresie 2009–2015 była członkiem rady zarządzającej EURO CBBM (ang. EURO Working Group on Operations Research in Computational Biology, Bioinformatics and Medicine), zaś od 2016 r. jest wiceszefem EURO CBBM (ang. EURO Working Group on Operations Research in Computational Biology, Bioinformatics and Medicine)[1]. W latach 2005–2007 należała do IEEE Computational Intelligence Society oraz IEEE Women in Engineering[1].
Dorobek naukowy
edytujSpecjalizuje się w algorytmice, biologii molekularnej, modelowaniu matematycznym oraz strukturach RNA[1]. W ramach badań rozwija wraz ze współpracownikami metody obliczeniowe służące do modelowania oraz analizy drugo- i trzeciorzędowej struktury RNA. Rezultatem tych prac jest platforma RNApolis, obejmująca zestaw narzędzi bioinformatycznych związanych z badaniem struktury RNA[2][5], wśród nich cieszący się bardzo dużym zainteresowaniem na świecie serwer RNAComposer umożliwiający automatyczne modelowanie struktur RNA na podstawie sekwencji nukleotydów[6][7]. Jest autorką artykułów naukowych w wysoko notowanych czasopismach naukowych[8], m.in. w Nature Methods, Bioinformatics, Nucleic Acids Research, RNA i PLoS Computational Biology[9][10][11].
Nagrody i wyróżnienia
edytujW 2006 otrzymała prestiżową nagrodę EDDA (EURO Doctoral Disseration Award) za najlepszą w Europie rozprawę doktorską w dziedzinie badań operacyjnych przyznaną przez ang. The Association of European Operational Research Societies[1].
Za prace nad metodami rozpoznawania i modelowania struktur 3D RNA otrzymała w 2017 r. nagrodę naukową Wydziału IV Nauk Technicznych PAN[12].
W 2023 r. otrzymała Brązowy Krzyż Zasługi[13].
Kierowane projekty badawcze
edytuj- 2017–2020: kierownik grantu NCN OPUS 12 „RNApolis – metody i algorytmy do modelowania i analizy struktury RNA”[14]
- 2020–2023: kierownik grantu NCN OPUS 18 „Eksploracja cech i modelowanie struktury kwadrupleksów”[15]
- 2021–2025: kierownik grantu NCN PRELUDIUM BIS 2 „Przewidywanie struktur 3D RNA z wykorzystaniem generatywnych sieci przestawnych”[16]
- 2025–2028: kierownik grantu NCN OPUS 27 „Modelowanie struktury RNA ukierunkowane na motywy funkcjonalne”
Przypisy
edytuj- ↑ a b c d e f g h i j Marta Szachniuk CV. cs.put.poznan.pl. [dostęp 2020-07-16]. (ang.).
- ↑ a b Zakład Bioinformatyki Strukturalnej [online], ICHB PAN [dostęp 2021-01-25] [zarchiwizowane z adresu 2021-01-21].
- ↑ a b Prof. dr hab. inż. Marta Xymena Szachniuk, [w:] baza „Ludzie nauki” portalu Nauka Polska (OPI PIB) [dostęp 2020-07-16].
- ↑ Pracownicy / dr hab. inż. Marta Xymena Szachniuk. Wydział Informatyki Politechniki Poznańskiej. [dostęp 2020-07-16]. [zarchiwizowane z tego adresu (2016-06-30)].
- ↑ RNApolis [online], Rnapolis.pl [dostęp 2020-07-16].
- ↑ Ludwika Tomala, RNA w 3D? Polacy zostawiają konkurencję w tyle!, [w:] Nauka w Polsce [online], PAP, 10 stycznia 2018 [dostęp 2020-07-16].
- ↑ RNAComposer [online], ICHB PAN [dostęp 2020-07-16] (ang.).
- ↑ Wykaz czasopism naukowych i recenzowanych materiałów z konferencji międzynarodowych wraz z przypisaną liczbą punktów [online], Ministerstwo Nauki i Szkolnictwa Wyższego, 20 grudnia 2019 [dostęp 2020-07-16].
- ↑ Marta Szachniuk (publikacje i cytowania). scholar.google.pl. [dostęp 2020-07-16]. (ang.).
- ↑ Marta Szachniuk. publons.com. [dostęp 2020-07-16]. (ang.).
- ↑ Marta Xymena Szachniuk. researchgate.net. [dostęp 2020-07-16]. (ang.).
- ↑ Przyznano tegoroczne Nagrody Wydziałowe PAN [online], Polska Akademia Nauk, 15 grudnia 2017 [dostęp 2020-07-16].
- ↑ Postanowienie Prezydenta Rzeczypospolitej Polskiej z dnia 10 października 2023 r. nr rej. 404/2023 o nadaniu odznaczeń (M.P. z 2023 r. poz. 1291).
- ↑ RNApolis - metody i algorytmy do modelowania i analizy struktury RNA [online], NCN [dostęp 2020-07-16].
- ↑ Eksploracja cech i modelowanie struktury kwadrupleksów [online], NCN [dostęp 2024-02-29].
- ↑ Przewidywanie struktur 3D RNA z wykorzystaniem generatywnych sieci przestawnych [online], NCN [dostęp 2024-02-29].
Linki zewnętrzne
edytuj- Marta Szachniuk (strona domowa). Wydział Informatyki Politechniki Poznańskiej. [dostęp 2020-07-16]. (ang.).